| Joniškio rajono savivaldybės administracija | 2 148 | 122,6 mln. € |
| UAB "Joniškio autobusų parkas" | 2 759 | 13,1 mln. € |
| viešoji įstaiga Joniškio ligoninė | 1 700 | 12,8 mln. € |
| Žemės ūkio bendrovė "Delikatesas" | 863 | 12,7 mln. € |
| UAB "Skaistgirio skalda" | 101 | 12,6 mln. € |
| Jurdaičių socialinės globos namai | 603 | 12 mln. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė JONIŠKIO BUTŲ ŪKIS | 273 | 10,9 mln. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "Joniškio vandenys" | 290 | 7,9 mln. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "JONIŠKIO HIDROSTATYBA" | 69 | 4,7 mln. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "Joniškio spedicija" | 98 | 4,4 mln. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "Fortum Joniškio energija" | 235 | 3,9 mln. € |
| UAB "Grebėstas" | 30 | 2,9 mln. € |
| Joniškio "Aušros" gimnazija | 555 | 2,8 mln. € |
| MB "Forginta" | 3 | 2,6 mln. € |
| Viešoji įstaiga Joniškio pirminės sveikatos priežiūros centras | 580 | 2,4 mln. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "Joniškio mechanizacija" | 117 | 2,4 mln. € |
| Joniškio "Saulės" pagrindinė mokykla | 210 | 1,8 mln. € |
| Joniškio r. Skaistgirio gimnazija | 653 | 1,7 mln. € |
| Joniškio istorijos ir kultūros muziejus | 868 | 1,7 mln. € |
| Joniškio žemės ūkio mokykla | 236 | 1,4 mln. € |
| Joniškio Mato Slančiausko progimnazija | 1 544 | 1,3 mln. € |
| Žydrūno Jackevičiaus IĮ | 7 | 1,2 mln. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "Joniškio duona" | 202 | 1,2 mln. € |
| IĮ "STIKSAS" | 42 | 1,1 mln. € |
| Joniškio vaikų lopšelis-darželis "Saulutė" | 158 | 1,1 mln. € |
| Joniškio vaikų darželis "Vyturėlis" | 951 | 1,1 mln. € |
| Joniškio r. Žagarės gimnazija | 134 | 1 mln. € |
| UAB "Elpromas" | 30 | 1 mln. € |
| UAB 'Delikatesas 1937' | 103 | 999,4 tūkst. € |
| VšĮ "Pievų paukščiai" | 7 | 896 tūkst. € |
| Joniškio kultūros centras | 383 | 880,8 tūkst. € |
| Joniškio vartotojų kooperatyvas | 417 | 854,2 tūkst. € |
| Joniškio r. pagrindinė mokykla | 128 | 734,6 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "PASIENIS" | 176 | 729,1 tūkst. € |
| Joniškio rajono vaiko ir šeimos gerovės centras | 208 | 649,7 tūkst. € |
| MB "Statoramas" | 23 | 612,6 tūkst. € |
| Joniškio rajono savivaldybės Jono Avyžiaus viešoji biblioteka | 834 | 521,4 tūkst. € |
| Joniškio turizmo ir verslo informacijos centras | 467 | 513,2 tūkst. € |
| Joniškio socialinių paslaugų ir užimtumo centras | 799 | 506,3 tūkst. € |
| Žagarės specialioji mokykla | 303 | 475,7 tūkst. € |
| UAB Baltic Xmas Trees | 16 | 461,9 tūkst. € |
| Joniškio Algimanto Raudonikio meno mokykla | 441 | 404 tūkst. € |
| Joniškio sporto centras | 939 | 397,7 tūkst. € |
| UAB "Joniškio baldai" | 63 | 368,8 tūkst. € |
| Joniškio rajono savivaldybės visuomenės sveikatos biuras | 229 | 366,6 tūkst. € |
| Artūro Rutkaus individuali įmonė | 93 | 357,4 tūkst. € |
| Žagarės kultūros centras | 851 | 356,2 tūkst. € |
| Joniškio rajono švietimo centras | 1 055 | 334,5 tūkst. € |
| Joniškio vaikų lopšelis-darželis "Ąžuoliukas" | 59 | 307,9 tūkst. € |
| UAB "Eltida" | 66 | 303,7 tūkst. € |
| MB "Šokantys fontanai" | 35 | 280,1 tūkst. € |
| UAB "INFRASTRUKTŪRA" | 41 | 275,3 tūkst. € |
| UAB "Ainex" | 15 | 250,7 tūkst. € |
| Viliaus Jono Butkaus individuali įmonė | 1 | 242,9 tūkst. € |
| MB "Tomosa" | 7 | 239,4 tūkst. € |
| UAB "JONIŠKIO GRŪDAI" | 22 | 235,3 tūkst. € |
| ŽŪB "Virčiuvis" | 368 | 233,7 tūkst. € |
| UAB "HZR" | 60 | 227,7 tūkst. € |
| Sigito Rimkevičiaus komercinė įmonė | 80 | 215,1 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "Baltijos gėrimai" | 265 | 204,8 tūkst. € |
| UAB "Medžio prekyba" | 17 | 200,7 tūkst. € |
| Editos Gaidjurgienės individuali įmonė | 550 | 176,5 tūkst. € |
| UAB "ŽEMRESTA" | 15 | 143,9 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "TOMIDAS" | 1 | 127,3 tūkst. € |
| Stanislavos Berklovienės individuali įmonė | 92 | 121,5 tūkst. € |
| UAB "Žiemgalos prekyba" | 258 | 111,5 tūkst. € |
| Joniškio rajono partnerystės vietos veiklos grupė | 7 | 99,7 tūkst. € |
| UAB "Ginadenta" | 1 | 96 tūkst. € |
| UAB "VISAMIDA" | 11 | 93,6 tūkst. € |
| UAB "Narbona" | 4 | 87,1 tūkst. € |
| UAB STATARAS | 8 | 80,2 tūkst. € |
| Faustos Užkuraitienės individuali įmonė | 36 | 78,1 tūkst. € |
| Redo Kakčiuko individuali įmonė | 107 | 76,1 tūkst. € |
| UAB "Total Industry Service" | 13 | 66,5 tūkst. € |
| VšĮ "Minčių takas" | 24 | 64,6 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "SIDABRĖS" LAIKRAŠČIO REDAKCIJA | 107 | 56,8 tūkst. € |
| UAB "Tavo įrankis" | 75 | 54,4 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "SV Servisas" | 32 | 51,8 tūkst. € |
| UAB "JA Prekyba" | 4 | 50,7 tūkst. € |
| Romo Sperskio medienos apdirbimo įmonė | 12 | 49,4 tūkst. € |
| Joniškio rajono Skaistčio žemės ūkio bendrovė | 51 | 45,4 tūkst. € |
| Joniškio rajono savivaldybės priešgaisrinė tarnyba | 16 | 43,4 tūkst. € |
| Algirdo Berklovo individuali įmonė | 10 | 40 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "Skaisti giria" | 10 | 39,1 tūkst. € |
| UAB "Baltmėsa" | 5 | 37,6 tūkst. € |
| UAB "Tiesus kelelis" | 4 | 36,1 tūkst. € |
| UAB "Vaido medis" | 24 | 32,9 tūkst. € |
| V. Kupino firma "Vajulitas" | 218 | 31,7 tūkst. € |
| MB "Šilrada" | 7 | 27 tūkst. € |
| JONIŠKIO RAJONO BARIŪNŲ ŽEMĖS ŪKIO BENDROVĖ | 2 | 25,6 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "STOPREMA" | 4 | 25,3 tūkst. € |
| UAB "REGIDENTA" | 2 | 24 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "Miltinuko receptas" | 12 | 21,4 tūkst. € |
| Gintaro Čepelės IĮ | 3 | 19,5 tūkst. € |
| UAB "VCH Dental" | 1 | 15 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "Fortūna" | 66 | 13,1 tūkst. € |
| G. Petrėno individuali įmonė | 3 | 13 tūkst. € |
| Uždaroji akcinė bendrovė "RentAuto" | 2 | 12,5 tūkst. € |
| Joniškio miesto vietos veiklos grupė | 6 | 12,3 tūkst. € |
| UAB "Veidruna" | 1 | 12 tūkst. € |